Laboratorio di Bioinformatica - Scheda 51 (S51)
DATI DEL LABORATORIO:
Laboratorio di Bioinformatica
AdF: 4. Analisi Dati e Modellistica
Dove siamo: Via Maragliano 77, piano terra, stanza 005
PERSONALE:
Responsabile Scientifico: Matteo Buti
Referente tecnico:
Responsabile gestione smaltimento dei rifiuti: Susanna Pucci
Altro personale: Alice Checcucci, Donatella Paffetti, Walter Vieri (dottorando), Riccardo Marziali (dottorando),
ATTIVITÀ E LINEE DI RICERCA:
Il Laboratorio di Bioinformatica, coordinato dal prof. Matteo Buti, è uno strumento fondamentale per le nostre ricerche nel campo della genetica agraria, in quanto ci permette di affrontare in modo efficace e su larga scala l’analisi dei dati genomici, epigenomici, trascrittomici, metabolomici e fenotipici legati alle specie che studiamo.
Le principali attività di ricerca del nostro laboratorio includono:
- Studi di trascrittomica (RNA-seq)
- Studi di epigenomica
- Assemblaggio e annotazione di genomi
- Identificazione di geni associati a tratti agronomici rilevanti
- Analisi della diversità genetica tra popolazioni o accessioni
- Analisi di marker molecolari, con sviluppo di mappe genetiche e mappaggio di QTL
- Applicazione di strumenti statistici e tecniche di machine learning per correlare genotipi, variabili ambientali e fenotipi
Tali attività ci permettono di elaborare grandi quantità di dati -omici e di ricavare informazioni chiave per comprendere i meccanismi molecolari alla base di tratti agronomici complessi, come la resistenza a stress biotici e abiotici, l’efficienza d’uso dei nutrienti, e le risposte molecolari di diverse accessioni a stimoli esterni comuni.
Nel laboratorio si svolgono ricerche sia di base che applicate. Collaboriamo attivamente con gruppi di ricerca nazionali e internazionali, partecipando a progetti multidisciplinari orientati allo sviluppo di un’agricoltura sostenibile, resiliente e ad alto valore aggiunto. La formazione di studenti e giovani ricercatori rappresenta inoltre un obiettivo strategico, con attività didattiche dedicate all’uso di software bioinformatici, linguaggi di programmazione (come R) e piattaforme per l’analisi di big data in ambito agrario.
STUMENTAZIONI:
Supermicro server con 48 CPU Intel Xeon Gold 5220R; Sistema operativo: Ubuntu 22.04.5 LTS; Storage: 1 SSD Samsung, 6 hard disk Western Digital.
Ultimo aggiornamento
09.03.2026